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玉米加工機械傳統濕法加工中，玉米浸漬水的分離和利用存在較大問題：浸漬水在蒸發器濃縮，濃縮物經干燥并入玉米蛋白飼料(一種價格低廉的副產品)；大量水蒸發的耗能極大；浸漬水所含的長鏈蛋白質和糖常常會污染蒸發器，故維修費用頗高。
膜分離技術的應用，為浸漬水的分離和利用打開了新的途徑。浸漬水的膜分離一般遵循兩種路線：
1) 用無機膜分離浸漬水。截留物包含長鏈蛋白質，干燥后并入谷朊粉(一種價格為玉米蛋白飼料四倍的副產品)。透過液在蒸發器濃縮，在此很少發生污染。透過液亦可經消毒而直接進入發酵工段。
2) 浸漬水在進入蒸發器前，先用反滲透膜除去57%的水，由此大大降低蒸發所需的能耗。蒸發濃縮物經干燥后并入玉米蛋白飼料。
